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Titre : |
Evolution de la diversité génétique intra-population et de sa structure : étude d'un modèle de simulation spatialisé en vue de la gestion des ressources génétiques forestières tropicales
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Auteur(s) : | Agnès Doligez, Auteur (et co-auteur) |
Type de document : | Thèse |
Sujets : | Génétique ; Forêt tropicale ; Pollinisation ; Génotype ; Guyane française ; Amérique du Sud |
Résumé : |
Ce travail est une contribution à l'acquisition des bases théoriques nécessaires à l'élaboration de plans d'aménagement des forêts tropicales prenant en compte la gestion dynamique in situ des ressources génétiques forestières. Deux volets complémentaires sont abordés : d'une part, l'élaboration et l'étude d'un modèle spatialisé d'évolution de la diversité génétique à l'intérieur d'une population finie ; d'autre part, la caractérisation du régime de reproduction et la description de la diversité génétique dans une population de Carapa procera (Meliaceae), une espèce d'arbre de la forêt guyanaise Le modèle utilisé est un modèle stochastique d'isolement par la distance pour une population finie spatialement structurée, avec possibilité d'autofécondation, de chevauchement des générations[...] Ce travail est une contribution à l'acquisition des bases théoriques nécessaires à l'élaboration de plans d'aménagement des forêts tropicales prenant en compte la gestion dynamique in situ des ressources génétiques forestières. Deux volets complémentaires sont abordés : d'une part, l'élaboration et l'étude d'un modèle spatialisé d'évolution de la diversité génétique à l'intérieur d'une population finie ; d'autre part, la caractérisation du régime de reproduction et la description de la diversité génétique dans une population de Carapa procera (Meliaceae), une espèce d'arbre de la forêt guyanaise Le modèle utilisé est un modèle stochastique d'isolement par la distance pour une population finie spatialement structurée, avec possibilité d'autofécondation, de chevauchement des générations, de sélection en faveur des hétérozygotes, et d'exploitation d'une partie des individus à intervalles de temps réguliers. Des simulations basées sur les hypothèses de ce modèle ont été utilisées pour l'étude des variations simultanées des différentes variables d'entrée : densité, taille de la population, distances de pollinisation, distances de dissémination, chevauchement des générations, coefficient de sélection, et taux d'exploitation. Les plans d'expérience utilisés ici (avec seulement deux valeurs extrêmes pour chaque variable d'entrée) ont permis de montrer que chacune des variables d'entrée a, au moins dans certains contextes, un effet important sur la répartition spatiale des individus, le taux d'allofécondation, la diversité génétique, et/ou l'organisation de cette diversité, à l'intérieur de la population qu'il existe de nombreuses interactions entre les variables d'entrée, rarement mises en évidence dans les travaux de simulation publiés jusqu'à présent (par exemple, la densité, la sélection et les distances de dissémination dont d'effet sur le taux d'allofécondation que quand les distances de pollinisation sont faibles) ; il est donc essentiel d'étudier les variations simultanées des différentes variables d'entrée, afin de caractériser entièrement les situations génétiques possibles chez les espèces forestières tropicales - qu'il est important de prendre en compte la répartition spatiale dans les modèles d'évolution de la diversité génétique intra-population et de son organisation (consanguinité, structure génotypique, et structure spatiale génétique), et que l'effet de l'agrégativité est en grande partie liée au déterminisme environnemental utilisé dans ce modèle pour le taux d'allofécondation que la présence d'exploitation diminue fortement l'hétérozygotie quand les distances de pollinisation sont faibles, ou quand ces distances sont élevées et la densité faible ; l'effet de l'exploitation semble principalement lié aux variations du taux d'allofécondation et des distances de dispersion. Par ailleurs, cette étude fournit quelques prédictions simples à tester à l'aide de données réelles, en particulier en ce qui concerne les liens entre variables de sortie. Les données génétiques et de biologie de la reproduction obtenues pour une population de Carapa procera, à l'aide de marqueurs isoenzymatiques (faible agrégativité, taux d'allofécondation élevé t:=O,8, forte diversité intra-population H-zO,2, indice de fixation négatif au stade adulte F=-O,2, et absence de structure spatiale génétique), ne remettent pas en cause les hypothèses du modèle. Cependant, ce début de validation du modèle doit être complété, en utilisant des données concernant d'autres espèces, et aussi en obtenant des tests de prédiction plus précis. |
Editeur(s) : | Paris : Institut national agronomique ; Montpellier : Centre de coopération International en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD)-Forêt |
Date de publication : | 1996 |
Format : | 2 vol. (247 p + annexes) |
Note(s) : |
(Thèse. INA Paris-Grignon. 1996) |
Langue(s) : | Français |
Lien vers la notice : | https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=83622 |
Exemplaires (9)
Localisation | Emplacement | Pôle | Section | Cote | Support | Disponibilité |
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Kourou | 1 - Facteur du milieu - Biologie | AgroParisTech-Kourou | 165.3.DOL.1996 | Papier | Empruntable Disponible | |
Kourou | 1 - Facteur du milieu - Biologie | AgroParisTech-Kourou | 165.3.DOL.1996 | Papier | Empruntable Disponible | |
Kourou | 1 - Facteur du milieu - Biologie | AgroParisTech-Kourou | 165.3.DOL.1996 | Papier | Empruntable Disponible | |
Kourou | 1 - Facteur du milieu - Biologie | AgroParisTech-Kourou | 165.3.DOL.1996 | Papier | Empruntable Disponible | |
Kourou | Archives | AgroParisTech-Kourou | ARCH - ONF 26 | Papier | Empruntable Disponible | |
Kourou | Archives | AgroParisTech-Kourou | ARCH - ONF 26 | Papier | Empruntable Disponible | |
Nancy | Bibliothèque | sans section | 42.349 | Papier | Empruntable Disponible | |
Palaiseau | Magasin - compactus | THE 1996 DOL | Papier | Consultable sur place Exclu du prêt | ||
Palaiseau | Magasin - compactus | THE 1996 DOL | Papier | Consultable sur place Exclu du prêt |