Manuel de spectrométrie de masse à l'usage des biochimistes / Filippo Rusconi (2011)

Public ISBD Titre : Manuel de spectrométrie de masse à l'usage des biochimistes Type de document : document multimédia Auteurs : Filippo Rusconi Editeur : Paris [France] : Editions Tec & Doc Année de publication : 2011 Importance : 1 vol. (XXVIII-640 p.), 1 CD-ROM Présentation : ill. en coul., couv. ill. en coul. Format : 25 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-7430-1341-7 Prix : 129 EUR Note générale : Notes bibliogr. Index. Annexes Langues : Français (fre) Anglais (eng) Catégories : Liste Plan de classement 4.2.2 (ELECTROCHIMIE-SPECTROSCOPIE-RMN) [Classement Massy] Thésaurus Agro-alimentaire SPECTROSCOPIE ; CHROMATOGRAPHIE ; PROTEINE ; LOGICIEL ; ACIDE NUCLEIQUE ; EPURATION ; GLUCIDE ; MODELE MATHEMATIQUE ; ANALYSE DES DONNEES ; ELECTROPHORESE Note de contenu : Logiciel "massXpert" de simulation et d'analyse de données de spectrométrie de masse (CD-ROM) Type de document : Livre Table des matières : Première partie : Spectrométrie de masse 1 Fondamentaux 1.1 Définitions 1.2 Spectrométrie de masse des biopolymères 1.3 Dissection de pics de masse résolus 1.4 Dissection de pics de masse non résolus 1.5 Interprétation de spectre 1.5.1 Déconvolution de spectre à pics de masse résolus 1.5.2 Déconvolution de spectre à pics de masse non résolus 1.6 Le pouvoir résolutif d'un instrument 1.7 Architecture d'un spectromètre de masse 2 Sources d'ions 2.1 Source d'ions MALDI 2.1.1 Fonctionnement d'une source MALDI 2.1.2 Préparation de l'échantillon 2.1.3 Caractéristiques des ions générés 2.2 Source d'ions ESI 2.2.1 Fonctionnement d'une source ESI 2.2.2 Préparation de l'échantillon 2.2.3 Caractéristiques des ions générés 2.2.4 Cas particulier de la source nanoESI 2.3 Conclusions 3 Analyseurs 3.1 Analyseurs temps-de-vol 3.1.1 Analyseur linéaire 3.1.2 Analyseur réflectron Analyseur quadrupôle 3.2 Analyseurs pièges à ions 3.3.1 Analyseur piège à ions quadrupolaire 3.3.2 Analyseur piège à ions linéaire 3.3.3 Conclusions 3.4 Analyseur résonance ionique cyclotronique 3.5 Analyseur piège à ions orbital 3.6 Combinaisons d'analyseurs 3.6.1 Spectromètre de masse à triple quadrupôle QqQ 3.6.2 Spectromètre de masse hybride Qq-TOF Deuxième partie : Chimie des biopolymères 4 Méthodes de purification 4.1 Généralités 4.2 Méthodes chromatographiques 4.2.1 Chromatographie d'exclusion 4.2.2 Chromatographie par échange d'ions 4.2.3 Chromatographie d'interactions hydrophiles 4.2.4 Chromatographie d'interactions hydrophobes 4.2.5 Chromatographie sur résine de phase inversée 4.2.6 Chromatographie par paire d'ions sur résine de phase inversée 4.2.7 Chromatographie d'affinité sur ions métalliques immobilisés 4.2.8 Chromatographie d'affinité 4.3 Méthodes en gel 4.3.1 Électrophorèse dénaturante en gel de polyacrylamide 4.3.2 Électrophorèse en gel de poly-acrylamide à deux dimensions 4.3.3 Électrophorèse non dénaturante en gel de polyacrylamide 5 Les protéines 5.1 Généralités 5.2 Structure 5.2.1 Structures de base 5.2.2 Édifices plus complexes : les oligopeptides 5.3 Production de peptides d'une protéine 5.4 Séparation et purification 5.4.1 Généralités 5.4.2 Purification de protéines et de peptides 5.5 Spectrométrie de masse des protéines 5.5.1 Calculs élémentaires de masse 5.5.2 Spectrométrie de masse MALDI 5.5.3 Spectrométrie de masse ESI 5.6 Spectrométrie de masse des peptides 5.6.1 Empreinte peptidique 5.6.2 Fragmentations en phase gazeuse 5.6.3 Méthode de calcul de masse des fragments 5.6.4 Applications de la spectrométrie de masse des peptides 5.6.5 Quantification de protéines 6 Les acides nucléiques 6.1 Généralités 6.2 Structure 6.2.1 Structures de base 6.2.2 Édifices plus complexes : les oligonucléotides 6.3 Séparation et purification 6.3.1 Généralités 6.3.2 Purification d'acides nucléiques 6.3.3 Exemples d'applications 6.4 Spectrométrie de masse de l'ADN 6.4.1 Calculs élémentaires de masse 6.4.2 Fragmentations en phase gazeuse 6.4.3 Spectrométrie de masse MALDI 6.4.4 Spectrométrie de masse ESI 6.4.5 Analyse de spectre 6.5 Spectrométrie de masse de l'ARN 6.5.1 Calculs élémentaires de masse 6.5.2 Fragmentations en phase gazeuse 6.5.3 Analyse de spectre 7 Les glucides 7.2.1 Structures de base 7.2.2 Édifices plus complexes : oligosaccharides et polysaccharides 7.2.3 La glycosylation des protéines 7.3 Séparation et purification 7.3.1 Généralités 7.3.2 Purification de protéines ou de peptides glycosylés 7.3.3 Libération des glycannes 7.3.4 Purification de glycannes 7.4 Spectrométrie de masse des glycannes 7.4.1 Calculs élémentaires de masse 7.4:2 Fragmentations en phase gazeuse 7.4.3 Spectrométrie de masse MALDI 7.4.4 Spectrométrie de masse ESI 7.5 Spectrométrie de masse des glycopeptides Troisième partie : Simulation et analyse de données. Le logiciel massXpert 8 massXpert : Généralités 9 XpertDef 9.1 Entités singulières 9.2 Entités plurielles 9.2.1 Les atomes 9.2.2 Les monomères 9.2.3 Les modifications 9.2.4 Les agents pontants 9.2.5 Les clivages 9.2.6 Les fragmentations 9.3 Enregistrer la définition 10 XpertCalc 10.1 Une mise en œuvre facile 10.2 Une calculatrice enregistreuse 10.3 Une calculatrice programmable 10.4 Le calculateur de ratios m/z 10.5 Le calculateur de massifs isotopiques 11 XpertEdit 11.1 La fenêtre principale 11.2 Édition de séquences 11.2.1 Codes multi-caractères 11.3 Sélections de séquences 11.4 Les menus du module XpertEdit 11.4.1 Le menu Fichier 11.4.2 Le menu Éditer 11.4.3 Le menu Chimie 11.5 Calculs de rapports m/z 11.6 Compositions 11.7 Options générales 11.7.1 Décimales 12 XpertMiner 12 Création de listes de paires (mlz, z) 12.1 Calculs sur liste unique 12.2 Calculs sur deux listes 12.2.1 Processus de comparaison 12.2.2 Exploitation des résultats 13 Personnaliser ses données 13.1 Le système de fichiers de massXpert 13.1.1 Les fichiers de la distribution 13.1.2 Les fichiers de l'utilisateur 13.2 Personnaliser ses données 13.2.1 Édition du fichier ldna.xml dans le module XpertDef 14 Annexes GNU General Public License Text Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=161354 Manuel de spectrométrie de masse à l'usage des biochimistes [document multimédia] / Filippo Rusconi . - Paris (France) : Editions Tec & Doc, 2011 . - 1 vol. (XXVIII-640 p.), 1 CD-ROM : ill. en coul., couv. ill. en coul. ; 25 cm. ISBN : 978-2-7430-1341-7 : 129 EUR Notes bibliogr. Index. Annexes Langues : Français (fre) Anglais (eng) Catégories : Liste Plan de classement 4.2.2 (ELECTROCHIMIE-SPECTROSCOPIE-RMN) [Classement Massy] Thésaurus Agro-alimentaire SPECTROSCOPIE ; CHROMATOGRAPHIE ; PROTEINE ; LOGICIEL ; ACIDE NUCLEIQUE ; EPURATION ; GLUCIDE ; MODELE MATHEMATIQUE ; ANALYSE DES DONNEES ; ELECTROPHORESE Note de contenu : Logiciel "massXpert" de simulation et d'analyse de données de spectrométrie de masse (CD-ROM) Type de document : Livre Table des matières : Première partie : Spectrométrie de masse 1 Fondamentaux 1.1 Définitions 1.2 Spectrométrie de masse des biopolymères 1.3 Dissection de pics de masse résolus 1.4 Dissection de pics de masse non résolus 1.5 Interprétation de spectre 1.5.1 Déconvolution de spectre à pics de masse résolus 1.5.2 Déconvolution de spectre à pics de masse non résolus 1.6 Le pouvoir résolutif d'un instrument 1.7 Architecture d'un spectromètre de masse 2 Sources d'ions 2.1 Source d'ions MALDI 2.1.1 Fonctionnement d'une source MALDI 2.1.2 Préparation de l'échantillon 2.1.3 Caractéristiques des ions générés 2.2 Source d'ions ESI 2.2.1 Fonctionnement d'une source ESI 2.2.2 Préparation de l'échantillon 2.2.3 Caractéristiques des ions générés 2.2.4 Cas particulier de la source nanoESI 2.3 Conclusions 3 Analyseurs 3.1 Analyseurs temps-de-vol 3.1.1 Analyseur linéaire 3.1.2 Analyseur réflectron Analyseur quadrupôle 3.2 Analyseurs pièges à ions 3.3.1 Analyseur piège à ions quadrupolaire 3.3.2 Analyseur piège à ions linéaire 3.3.3 Conclusions 3.4 Analyseur résonance ionique cyclotronique 3.5 Analyseur piège à ions orbital 3.6 Combinaisons d'analyseurs 3.6.1 Spectromètre de masse à triple quadrupôle QqQ 3.6.2 Spectromètre de masse hybride Qq-TOF Deuxième partie : Chimie des biopolymères 4 Méthodes de purification 4.1 Généralités 4.2 Méthodes chromatographiques 4.2.1 Chromatographie d'exclusion 4.2.2 Chromatographie par échange d'ions 4.2.3 Chromatographie d'interactions hydrophiles 4.2.4 Chromatographie d'interactions hydrophobes 4.2.5 Chromatographie sur résine de phase inversée 4.2.6 Chromatographie par paire d'ions sur résine de phase inversée 4.2.7 Chromatographie d'affinité sur ions métalliques immobilisés 4.2.8 Chromatographie d'affinité 4.3 Méthodes en gel 4.3.1 Électrophorèse dénaturante en gel de polyacrylamide 4.3.2 Électrophorèse en gel de poly-acrylamide à deux dimensions 4.3.3 Électrophorèse non dénaturante en gel de polyacrylamide 5 Les protéines 5.1 Généralités 5.2 Structure 5.2.1 Structures de base 5.2.2 Édifices plus complexes : les oligopeptides 5.3 Production de peptides d'une protéine 5.4 Séparation et purification 5.4.1 Généralités 5.4.2 Purification de protéines et de peptides 5.5 Spectrométrie de masse des protéines 5.5.1 Calculs élémentaires de masse 5.5.2 Spectrométrie de masse MALDI 5.5.3 Spectrométrie de masse ESI 5.6 Spectrométrie de masse des peptides 5.6.1 Empreinte peptidique 5.6.2 Fragmentations en phase gazeuse 5.6.3 Méthode de calcul de masse des fragments 5.6.4 Applications de la spectrométrie de masse des peptides 5.6.5 Quantification de protéines 6 Les acides nucléiques 6.1 Généralités 6.2 Structure 6.2.1 Structures de base 6.2.2 Édifices plus complexes : les oligonucléotides 6.3 Séparation et purification 6.3.1 Généralités 6.3.2 Purification d'acides nucléiques 6.3.3 Exemples d'applications 6.4 Spectrométrie de masse de l'ADN 6.4.1 Calculs élémentaires de masse 6.4.2 Fragmentations en phase gazeuse 6.4.3 Spectrométrie de masse MALDI 6.4.4 Spectrométrie de masse ESI 6.4.5 Analyse de spectre 6.5 Spectrométrie de masse de l'ARN 6.5.1 Calculs élémentaires de masse 6.5.2 Fragmentations en phase gazeuse 6.5.3 Analyse de spectre 7 Les glucides 7.2.1 Structures de base 7.2.2 Édifices plus complexes : oligosaccharides et polysaccharides 7.2.3 La glycosylation des protéines 7.3 Séparation et purification 7.3.1 Généralités 7.3.2 Purification de protéines ou de peptides glycosylés 7.3.3 Libération des glycannes 7.3.4 Purification de glycannes 7.4 Spectrométrie de masse des glycannes 7.4.1 Calculs élémentaires de masse 7.4:2 Fragmentations en phase gazeuse 7.4.3 Spectrométrie de masse MALDI 7.4.4 Spectrométrie de masse ESI 7.5 Spectrométrie de masse des glycopeptides Troisième partie : Simulation et analyse de données. Le logiciel massXpert 8 massXpert : Généralités 9 XpertDef 9.1 Entités singulières 9.2 Entités plurielles 9.2.1 Les atomes 9.2.2 Les monomères 9.2.3 Les modifications 9.2.4 Les agents pontants 9.2.5 Les clivages 9.2.6 Les fragmentations 9.3 Enregistrer la définition 10 XpertCalc 10.1 Une mise en œuvre facile 10.2 Une calculatrice enregistreuse 10.3 Une calculatrice programmable 10.4 Le calculateur de ratios m/z 10.5 Le calculateur de massifs isotopiques 11 XpertEdit 11.1 La fenêtre principale 11.2 Édition de séquences 11.2.1 Codes multi-caractères 11.3 Sélections de séquences 11.4 Les menus du module XpertEdit 11.4.1 Le menu Fichier 11.4.2 Le menu Éditer 11.4.3 Le menu Chimie 11.5 Calculs de rapports m/z 11.6 Compositions 11.7 Options générales 11.7.1 Décimales 12 XpertMiner 12 Création de listes de paires (mlz, z) 12.1 Calculs sur liste unique 12.2 Calculs sur deux listes 12.2.1 Processus de comparaison 12.2.2 Exploitation des résultats 13 Personnaliser ses données 13.1 Le système de fichiers de massXpert 13.1.1 Les fichiers de la distribution 13.1.2 Les fichiers de l'utilisateur 13.2 Personnaliser ses données 13.2.1 Édition du fichier ldna.xml dans le module XpertDef 14 Annexes GNU General Public License Text Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=161354

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