Accueil
Sélection de la langue
Adresse
Infodoc : Réseau des bibliothèques et centres de documentation d'AgroParisTechFrance
contact
Array
(
[TITRE] => <b>Type de document : </b>
[TITRE_CLEAN] => Type de document
[OPAC_SHOW] => 1
[TYPE] => list
[AFF] => Thèse
[ID] => 4
[NAME] => cp_typdoc
[DATATYPE] => integer
[VALUES] => Array
(
[0] => 1
)
)
| Titre : |
Dynamique d'activation des éléments transposables au cours de la formation d'un génome allopolyploïde : modèle d'étude : le colza (Brassica napus)
|
| Auteur(s) : |
Véronique Sarilar, Auteur (et co-auteur)
Philippe Brabant, Directeur de thèse (et co-directeur) AgroParisTech, Etablissement de soutenance |
| Type de document : | Thèse |
| Sujets : | Bioinformatique ; Colza ; Transposons |
| Résumé : |
[...] Dans le but d'étudier l'impact de l'allopolyploïdisation au niveau de réarrangements structuraux impliquant des ET [éléments transposables], nous avons développé une approche SSAP (sequence-specific amplification polymorphism). Nous avons choisi trois ET contrastés : un rétrotransposon de type Athila, la transposon CACTA Bot1 et un MITE. Pour ce dernier, nous avons été amenés à caractériser une famille spécifique des Brassica : BraSto. Elle présente les traces d'une multiplication récente au sein du génome des Brassica, et des indices en faveur d'un impact sur l'expression des gènes (association préférentielle avec l'espace génique et enrichissement en motifs spécifiques de facteurs de régulation). Au niveau des profils SSAP, amplifiés à l'aide d'amorces ancrées dans chacun des [...] [...] Dans le but d'étudier l'impact de l'allopolyploïdisation au niveau de réarrangements structuraux impliquant des ET [éléments transposables], nous avons développé une approche SSAP (sequence-specific amplification polymorphism). Nous avons choisi trois ET contrastés : un rétrotransposon de type Athila, la transposon CACTA Bot1 et un MITE. Pour ce dernier, nous avons été amenés à caractériser une famille spécifique des Brassica : BraSto. Elle présente les traces d'une multiplication récente au sein du génome des Brassica, et des indices en faveur d'un impact sur l'expression des gènes (association préférentielle avec l'espace génique et enrichissement en motifs spécifiques de facteurs de régulation). Au niveau des profils SSAP, amplifiés à l'aide d'amorces ancrées dans chacun des trois ET étudiés, leur comparaison entre colzas synthétiques et parents diploïdes n'a pas révélé d'explosion de leur transposition. Par contre, nous avons mis en évidence des remaniements structuraux au niveau des sites d'insertion et de probables modifications des profils de méthylation, affectant inégalement ces trois ET. [...] |
| Date de publication : | 2011 |
| Format : | 1 vol. (224 p.) / 30 cm |
| Note(s) : |
Spécialité : Biologie |
| Langue(s) : | Français |
| Lien vers la notice : | https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=224893 |
Exemplaires
| Localisation | Emplacement | Pôle | Section | Cote | Support | Disponibilité |
|---|---|---|---|---|---|---|
| aucun exemplaire | ||||||