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Étudier le régime alimentaire des espèces sauvages telles que le tapir (Tapirus terrestris), n'est pas toujours évident du fait des difficultés rencontrées pour observer ces animaux, très discrets et peu nombreux, dans un milieu aussi riche que celui de la forêt amazonienne. L'analyse des fèces s'avère être une alternative pratique et efficace qui a, en outre, l'avantage d'être non-invasive. Récemment développée, la technique du Barcoding permet d'identifier les espèces à partir de petits fragments de génome. dans cette étude, nous testons ce principe et, à partir de morceaux de végétaux récupérés dans les fèces, bous avons amplifié et séquencé le fragment chloroplastique trnH-psbA afin de déterminer les espèces consommées par le tapir en Guyane française. Une première partie de cette[...]

Étudier le régime alimentaire des espèces sauvages telles que le tapir (Tapirus terrestris), n'est pas toujours évident du fait des difficultés rencontrées pour observer ces animaux, très discrets et peu nombreux, dans un milieu aussi riche que celui de la forêt amazonienne. L'analyse des fèces s'avère être une alternative pratique et efficace qui a, en outre, l'avantage d'être non-invasive. Récemment développée, la technique du Barcoding permet d'identifier les espèces à partir de petits fragments de génome. dans cette étude, nous testons ce principe et, à partir de morceaux de végétaux récupérés dans les fèces, bous avons amplifié et séquencé le fragment chloroplastique trnH-psbA afin de déterminer les espèces consommées par le tapir en Guyane française. Une première partie de cette étude se consacre à la mise en place du protocole à partir de fèces issues du zoo, tandis qu'une deuxième aborde les expériences en milieu naturel où une dizaine de famille ont été identifié. Finalement, la faisabilité et fiabilité de la méthode sont discutées.

Studying wild species'diet as tapir is not easy due to their low density and elusive behavior, especially in rich ecosystem as tropical forest. Feces analysis can be a reliable and efficient alternative moreover being non -invasive. Recently developed, Barcoding allows species with a small part of their genomes. Here, we tested this method on vegetative fragments found inside dung piles by amplifying and sequencing the trnH-psbA intergenic spacer in order to identify plant browsed by tapir. In the first part of this study, we set up the protocol with feces collected in a zoo. In the second part, we analysed the diet composition of lowland tapir (Tapirus terrestris) in natural reserve of French Guiana were we found aroound ten families eaten. Finally, we discuss the feasibility and the reliability of this method.