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![Spatio-temporal transcriptome analysis of surface-associated multicellular assemblages of Bacillus subtilis](https://infodoc.agroparistech.fr/img_cache/pmb_agroparistech_record_214182.webp)
Titre : |
Spatio-temporal transcriptome analysis of surface-associated multicellular assemblages of Bacillus subtilis
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Auteur(s) : | Yasmine Dergham, Auteur |
Type de document : | Thèse |
Sujets : | Bacillus subtilis ; Biofilms -- Surfaces ; Biofilms -- Aspect moléculaire ; Transcriptome -- Aspect génétique ; Micro-environnement cellulaire |
Résumé : |
Les cellules microbiennes sont fréquemment associées à diverses surfaces, formant des assemblages multicellulaires complexes, appelées biofilms. Malgré certains effets bénéfiques de ces structures, elles sont souvent impliquées dans des infections chroniques humaines. Une souche non domestiquée de Bacillus subtilis (NDmed), récemment isolée d'un hôpital, s'est avérée former des biofilms immergés hautement structurés, hyper-résistants à l'action des biocides et capables de protéger des agents pathogènes lorsqu'ils y sont associés. Ainsi, comprendre comment ces communautés liées aux surfaces se forment est crucial pour leur contrôle. Des études sur les biofilms de B. subtilis, principalement sous forme de colonies et de pellicules, avaient permis d'identifier plusieurs gènes impliqués d[...]
Les cellules microbiennes sont fréquemment associées à diverses surfaces, formant des assemblages multicellulaires complexes, appelées biofilms. Malgré certains effets bénéfiques de ces structures, elles sont souvent impliquées dans des infections chroniques humaines. Une souche non domestiquée de Bacillus subtilis (NDmed), récemment isolée d'un hôpital, s'est avérée former des biofilms immergés hautement structurés, hyper-résistants à l'action des biocides et capables de protéger des agents pathogènes lorsqu'ils y sont associés. Ainsi, comprendre comment ces communautés liées aux surfaces se forment est crucial pour leur contrôle. Des études sur les biofilms de B. subtilis, principalement sous forme de colonies et de pellicules, avaient permis d'identifier plusieurs gènes impliqués dans la formation et la régulation des structures 3D, mais leur implication dans le modèle de biofilm immergé restait incertaine. Afin de mieux comprendre les stratégies moléculaires se déroulant au cours du développement des biofilms, plus particulièrement le modèle immergé, nous avons réalisé des études génétiques comparatives par différentes approches, notamment le profilage spatio-temporelle du transcriptome, l'identification et la construction de mutants cibles et la MCBL/4D couplée à l'utilisation de fusions transcriptionnelles fluorescentes. Les données obtenues à partir de l'analyse RNA-seq ont offert une vue globale sur les différents profils d'expression génétique pour chacune des populations spatiales associées aux surfaces. La comparaison entre ces profils transcriptomiques a révélé des similitudes et des différences entre des compartiments spatialement distincts. De plus, la visualisation spatio-temporelle in situ de l'expression de plusieurs gènes au niveau de la cellule unique a révélé de nouvelles paternes d’expressions suggérant de nouveaux mécanismes de régulation de ces communautés structurées.
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Editeur(s) : | Gif-sur-Yvette [France] : Université Paris-Saclay ; Paris [France] : AgroParisTech |
Date de publication : | 2021 |
Format : | 215 p. |
Langue(s) : | Anglais |
Lien vers la notice : | https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=214182 |
Exemplaires
Localisation | Emplacement | Pôle | Section | Cote | Support | Disponibilité |
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aucun exemplaire |
Documents numériques (1)
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