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![Typage et sous-typage du genre Salmonella basé sur le polymorphisme des loci CRISPR](https://infodoc.agroparistech.fr/img_cache/pmb_agroparistech_record_209270.webp)
Titre : |
Typage et sous-typage du genre Salmonella basé sur le polymorphisme des loci CRISPR
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Auteur(s) : | Laetitia Fabre, Auteur |
Type de document : | Thèse |
Sujets : | Salmonella -- Thèses et écrits académiques ; Microbiologie alimentaire Bactériologie |
Résumé : |
Les salmonelloses sont la première cause de diarrhées bactériennes d’origine alimentaire dans les pays industrialisés, demeurant un problème de santé publique majeur. Depuis près d’un siècle, le sérotypage reste la méthode de référence pour l’identification des salmonelles. Basée sur la recherche d’antigènes (un antigène de paroi et un ou deux antigènes flagellaires), cette technique manuelle est longue (3 à 6 jours) et très coûteuse (salaire et utilisation de >150 sérums commercialisés de typage). Près de 2 600 sérotypes ont été décrits chez le genre Salmonella. Leur distribution étant la base des investigations épidémiologiques, une identification rapide est primordiale. Par ailleurs, du fait de la prédominance de certains sérotypes, une étape supplémentaire de sous-typage (électrop[...]
Les salmonelloses sont la première cause de diarrhées bactériennes d’origine alimentaire dans les pays industrialisés, demeurant un problème de santé publique majeur. Depuis près d’un siècle, le sérotypage reste la méthode de référence pour l’identification des salmonelles. Basée sur la recherche d’antigènes (un antigène de paroi et un ou deux antigènes flagellaires), cette technique manuelle est longue (3 à 6 jours) et très coûteuse (salaire et utilisation de >150 sérums commercialisés de typage). Près de 2 600 sérotypes ont été décrits chez le genre Salmonella. Leur distribution étant la base des investigations épidémiologiques, une identification rapide est primordiale. Par ailleurs, du fait de la prédominance de certains sérotypes, une étape supplémentaire de sous-typage (électrophorèse en champs pulsé-PFGE) est nécessaire pour une meilleure discrimination et la mise en évidence de clones épidémiques (5 jours en plus du délai du sérotypage). Une nouvelle méthode plus rapide, robuste avec des résultats facilement interchangeables entre laboratoires est nécessaire. C’est dans cette optique que nous avons commencé l’étude du polymorphisme de la région CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) chez Salmonella. Notre étude portant sur 134 sérotypes a mis en évidence la corrélation entre sérotype et dans certains cas sous-types et profil CRISPR. Ce travail nous a également permis de développer une nouvelle méthode de sous-typage du sérotype Typhimurium (CRISPOL) ainsi qu’une PCR spécifique pour la détection rapide des sérotypes Typhi et Paratyphi A et une autre pour l’identification du clone ST198 du sérotype Kentucky.
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Editeur(s) : | Paris [France] : AgroParisTech |
Date de publication : | 2017 |
Format : | 1 vol. (116 p.) / Ill. en coul.graph. |
Note(s) : |
Bibliogr. p.64-78
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Langue(s) : | Français |
Lien vers la notice : | https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=209270 |
Exemplaires
Localisation | Emplacement | Pôle | Section | Cote | Support | Disponibilité |
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aucun exemplaire |