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La famille des Potyvirus représentent à elle seule 25% des maladies virales des plantes, qui s’accompagnent souvent de sévères symptômes empêchant la commercialisation des fruits. Du fait de la large gamme de plante hôtes et de pucerons vecteurs les Potyvirus se dispersent facilement et rapidement dans leur environnement. Aujourd’hui les moyens de lutte contre les Potyvirus, sont multiples mais le moyen de lutte le plus répandu est l’utilisation de la résistance génétique des variétés, combiné à des pratiques culturales adaptées(nettoyage des parcelles, prévention d’attaque de pucerons…). Le marché courgette pour HM.Clause est la 4 ème source de bénéfice pour l’entreprise. Les résistances développées au sein de chaque variété est un point très concurrentiel. Il se pose donc la questio[...]

La famille des Potyvirus représentent à elle seule 25% des maladies virales des plantes, qui s’accompagnent souvent de sévères symptômes empêchant la commercialisation des fruits. Du fait de la large gamme de plante hôtes et de pucerons vecteurs les Potyvirus se dispersent facilement et rapidement dans leur environnement. Aujourd’hui les moyens de lutte contre les Potyvirus, sont multiples mais le moyen de lutte le plus répandu est l’utilisation de la résistance génétique des variétés, combiné à des pratiques culturales adaptées(nettoyage des parcelles, prévention d’attaque de pucerons…). Le marché courgette pour HM.Clause est la 4 ème source de bénéfice pour l’entreprise. Les résistances développées au sein de chaque variété est un point très concurrentiel. Il se pose donc la question de l’utilisation de QTL appropriés sur chaque marché. En effet, la Grande diversité de QTL de résistances quantitatives aux Potyvirus, combinée au fort nombre de souches de ces mêmes virus porte à réflexion. La question de l’efficacité de chaque QTL sur tout type de souche se pose alors. L’objectif de cette étude est donc d’avoir une meilleure connaissance de ces pathogènes pour ce qui est de leur distribution géographique, de leur agressivité et de leur diversité moléculaire, ainsi que l’impact de chaque isolat sur un génotype donné. Le deuxième objectif est de réaliser une classification phylogénétique des différents isolats de Potyvirus et plus particulièrement du WMV. De cette façon on souhaite aboutir à une connaissance plus fine des relations d’apparentement entre les différents isolats. Pour mener à bien ces différents objectifs plusieurs approches seront menées. Tout d'abord, des tests en serres pour phénotyper 15 génotypes de courgettes, ainsi que leur comportement pour neufs isolats seront mis en place. De plus, des analyses moléculaires (extraction d’ARN, RT-PCR, et séquençage), et phylogénétiques seront réalisés pour caractériser la diversité génétique des isolats de Potyvirus. Après analyses des données accumulées, on trouve 5 clusters de WMV répartis dans le monde selon un schéma précis. De plus, l’analyse statistique des données phénotypiques a permis de démontrer l’existence d’une résistance souche spécifique sur fruits et sur feuilles selon la composition de QTL considérée. Cette étude permet donc de valider l’utilité de certains Isolats utilisés lors de la sélection et donne des pistes et des outils de recherche pour la caractérisation des isolats rencontrés dans le futur. La poursuite de cette étude pourrait amener à caractériser la spécificité de résistance de chaque QTL utilisés lors de l’amélioration variétale chez HM.Clause.

Potyvirus family represents 25% of the viral plant diseases, which often come along with severe symptoms preventing the ratio of marketable fruits. Because of the wide range of plants hosts and thanks to aphids which transmit those pathogens ,Potyvirus scatters easily and quickly in their environment. Nowadays, the ways of managingPotyvirus are multiple but the most wide-spread way is the use of genetic resistance from varieties, combined with cultural practices like cleaning plots, aphids prevention. Zucchini market is the fourth source of benefits for the HM.Clause company. Resistance developed within every variety is a very competitive issue. The question of the QTL used in each market is asked. The multiple QTL resistance to Potyvirus, toward the huge diversity of strain of this virus leads us to think about the choice of QTL combination in each plant. The question of the efficiency of every QTL on every strain is now arised. Objectives of this study are to have a better knowledge of these viruses as for their geographical distribution, for their aggressiveness, for their molecular diversity, and for the impact of every isolate on a given genotype. The second objective is to realize a phylogenetic classification of Potyvirus isolates, and more particularly of WMV. In this way we wish to end in a more specific knowledge of the relationship between all the WMV isolates. To bring these objectives to a successful conclusion, several approaches will be led. First of all, greenhouses tests of 15 genotypes under 9 isolates conditions have been set up. Furthermore, molecular analyses like extraction of RNA, RT-PCR and sequencing have been done. All this in order to characterize the genetic diversity of the Potyvirus isolates. After analyzing all the data we get, we find five clusters of WMV distributed in the world according to a precise plan. Furthermore, the statistical analyses of phenotyping data allowed to demonstrate the existence of resistance specificity on fruits, and leaves to WMV according to the composition of considered QTL. This study also allow us to validate the use of certain isolates during the breeding process. It also give us newer tools for a future characterization of a potential new isolates. The continuation of this study could bring us to characterize the specificity of resistance of every QTL toward WMV used during the varietal improvement at HM.CLAUSE.