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Analyse des déterminants extrinsèques de l’évolution des résistances aux fongicides chez le champignon Zymoseptoria tritici, l’agent responsable de la septoriose du blé

Titre :	Analyse des déterminants extrinsèques de l’évolution des résistances aux fongicides chez le champignon Zymoseptoria tritici, l’agent responsable de la septoriose du blé Ajouter au panier
Auteur(s) :	Maxime Garnault, Auteur (et co-auteur) Ivan Sache, Tuteur Olivier David, Responsable de stage Anne-Sophie Walker, Responsable de stage
Type de document :	Mémoire
Filière :	Ing. DA : PISTv -- Produire et innover dans les systèmes techniques végétaux
Sujets :	Résistance aux fongicides ; Blé ; Maladie fongique Blé -- Effets des fongicides ; Blé -- Maladies ; Blé -- Maladies -- Lutte contre
Résumé :	La septoriose (Zymoseptoria tritici) est une des maladies les plus dommageables pour la culture de blé en France et dans le monde. La lutte chimique reste aujourd’hui le principal moyen de lutte contre cette maladie. Mais dû à l’apparition de résistances dans les populations de septoriose, elle est de moins en moins efficace. Parallèlement, pour des raisons environnementales et de santé publique, le contexte législatif européen et français tend à diminuer le nombre et la diversité des molécules autorisées dans les produits phytopharmaceutiques. Une gestion optimale et durable de la lutte chimique nécessite de comprendre quels sont les déterminants de l’évolution de la résistance du pathogène. Nous avons donc développé un modèle décrivant l’évolution des fréquences d’occurrence des phé[...] La septoriose (Zymoseptoria tritici) est une des maladies les plus dommageables pour la culture de blé en France et dans le monde. La lutte chimique reste aujourd’hui le principal moyen de lutte contre cette maladie. Mais dû à l’apparition de résistances dans les populations de septoriose, elle est de moins en moins efficace. Parallèlement, pour des raisons environnementales et de santé publique, le contexte législatif européen et français tend à diminuer le nombre et la diversité des molécules autorisées dans les produits phytopharmaceutiques. Une gestion optimale et durable de la lutte chimique nécessite de comprendre quels sont les déterminants de l’évolution de la résistance du pathogène. Nous avons donc développé un modèle décrivant l’évolution des fréquences d’occurrence des phénotypes résistants aux modes d’action fongicides chez Z. tritici en France. Ce modèle décrit les fréquences d’un phénotype en fonction de sa répartition initiale et de facteurs de sélection dépendant du contexte géographique et pédoclimatique, de l’utilisation des fongicides à l’échelle régionale, ainsi que des conditions agronomiques des essais. Dans un cadre bayésien, par MCMC, nous avons estimé les paramètres de ce modèle et testé leur significativité. Cette analyse a ainsi permis de mettre en évidence plusieurs facteurs structurants les populations de septoriose : la région (structuration spatiale), l’année (structuration temporelle) et nous avons aussi identifié un facteur de sélection extrinsèque à la sélection locale (au champ) : l’application régionale des fongicides anti-septoriose. Ces résultats préliminaires seront utilisés par la suite dans le cadre d’une thèse, pour développer un modèle de prédiction de l’évolution des fréquences de résistance. Ce modèle devrait aider à construire des stratégies de déploiement des fongicides plus économes et plus efficaces dans le cadre de la gestion des résistances. The Septoria tritici blotch (STB, Zymoseptoria tritici) is one of the most damaging diseases on winter wheat through France and the entire world. Nowadays, fungicide application still remains the main tool to control this disease. But it is less and less efficient due to the emergence of resistant strains in Septoria population. At the same time, for environmental and human health purposes, European and French legislative background tends to reduce the number and the diversity of molecules allowed in plant protection inputs. An optimal and sustainable use of chemical control requires the understanding of the key factors that affect the evolution of pathogen resistance. We developed a model that describes the frequency of the resistant strains observed in France. It includes an initial distribution of the strains and selection factors such as geography, soil and climate, regional use of fungicides and the agronomic characteristics of trials where frequencies were measured. In a Bayesian approach, using MCMC algorithm, we estimated and tested the significance of those factors. We highlighted several factors that have effect on the structure of Septoria population: the region (space structure), the year (time structure), and also the regional use of anti-Septoria fungicides as an extrinsic factor of local selection (in field). Those results will be used in another analysis that will be a part of a thesis. The thesis will aim the construction of a predictive model of the evolution of resistant phenotypes. It should help to build new deployment strategies for fungicides more economic and more efficient to manage resistance.
Editeur(s) :	Paris [France] : AgroParisTech
Date de publication :	2016
Format :	61 p.
Note(s) :	Diplôme d'ingénieur AgroParisTech, Mémoire de fin d'études, Dominante d’approfondissement : PISTv (Produire et Innover dans les Systèmes Techniques végétaux), 2016
Langue(s) :	Français ; Anglais
Confidentiel ou embargo jusqu'au :	01/09/2021
Lien vers la notice :	https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=187811