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CHAPITRE 1 - LA COLLECTE DE L'ÉNERGIE
1.1 - Respirations et fermentations
1.2 - Le rôIe des fermentations
1.3 - ATPases - ATP synthases
1.4 - Cytochromes
1.5 - Complexes de type bc1
1.6 - Oxydases respiratoires terminales
1.7 - Phototrophie non-oxygénique
1.8 - Les cyanobactéries
Conclusion
CHAPITRE 2 - GÉNOMES - ADAPTATIONS - COMMUNICATIONS
2.1 - La génomique des micro-organismes
2.2 - Protéomique et c[...]

CHAPITRE 1 - LA COLLECTE DE L'ÉNERGIE
1.1 - Respirations et fermentations
1.2 - Le rôIe des fermentations
1.3 - ATPases - ATP synthases
1.4 - Cytochromes
1.5 - Complexes de type bc1
1.6 - Oxydases respiratoires terminales
1.7 - Phototrophie non-oxygénique
1.8 - Les cyanobactéries
Conclusion
CHAPITRE 2 - GÉNOMES - ADAPTATIONS - COMMUNICATIONS
2.1 - La génomique des micro-organismes
2.2 - Protéomique et complexes multi-protéiques
2.3 - Transferts génétiques horizontaux
2.4 - Plasmides
2.5 - Séquences d'insertion - Transposition
2.6 - Les transposons simples et composites
2.7 - Intégrons et cassettes
2.8 - La biologie particulière des biofilms
2.9 - Communication et bioluminescence
Conclusion rapide
CHAPITRE 3 - OXYDATIONS MINÉRALES
3.1 - Un cycle naturel du méthane
3.2 - Le méthane, source de carbone et d'énergie
3.3 - Croissance sur méthane et méthanol
3.4 - Méthanotrophes contre organochlorés
3.5 - Halométhanes
3.6 - L'oxydation de l'ammoniac
3.7- Monoxyde de carbone et carboxydotrophes
3.8 - Du sulfure au sulfate
3.9 - Elimination de composés soufrés simples
3.10 - L'oxydation du fer et du manganèse
3.11 - Cyanure - cyanate - thiocyanate
Conclusion brève
CHAPITRE 4 - HYDROGÈNE - ACÉTATE - MÉTHANE
4.1 - Hydrogène et hydrogénases
4.2 - Les hydrogénases sont régulées
4.3 - Bactéries acétogènes
4.4 - La genèse du méthane
4.5 - Les étapes de la méthanogenèse
4.6 - L'énergie de l'hétérodisulfure réductase
4.7 - De l'acide acétique au méthane
4.8 - Méthanogènes et biodégradations
4.9 - Hydrogénosomes
Conclusion CHAPITRE 5 - AZOTE ET ANAÉROBIOSE
5.1 - Le cycle biologique de l'azote
5.2 - Ceux qui assimilent l'azote
5.3 - La nitrogénase
5.4 - Contrale de l'assimilation de l'azote
5.5 - Les voies du nitrate
5.6 - Le passage à l'anaérobiose
5.7 - Une optimisation très poussée
Conclusion
CHAPITRE 6 - RÉDUCTION DES OXYDES D'AZOTE
6.1 - Nitrate réductases et molybdène
6.2 - Nitrate réductases variées
6.3 - La réduction des nitrites
6.4 - Le passage direct du nitrite à l'ammonium
6.5 - De l'oxyde nitrique à l'oxyde nitreux
6.6 - De N2O au diazote
6.7 - Des champignons dénitrifient
En guise de conclusion
CHAPITRE 7 - OXYDATIONS ANAÉROBIES DIVERSES
7.1 - Des accepteurs variés et inattendus
7.2 - Du sulfate au sulfure
7.3 - Biochimie de la réduction du sulfate
7.4 - Le fer et le manganèse comme accepteurs anaérobies
7.5 - Déshalogénation respiratoire - Oxyde de chlore
Conclusion sommaire
CHAPITRE 8 - L'OXYGÉNATION DES AROMATIQUES
8.1 - Introduction
8.2 - L'oxygénation du benzène
8.3 - L'attaque du toluène et du styrène
8.4 - Des oxygénases aux cibles nombreuses et variées
8.5 - La naphtalène dioxygénase
8.6 - L'abondance naturelle des phénols
8.7 - Dérivés nitrés
8.8 - Haloaromatiques
8.9 - Le benzoate et les halobenzoates
8.10 - Aromatiques fluorés
Conclusion
CHAPITRE 9 - OUVERTURE INTRADIOL DU CYCLE AROMATIQUE
9.1- Rupture aérobie du cycle
9.2 - Voies ortho
9.3 - Régulateurs
9.4 - Voies ortho modifiées
9.5 - Les dioxygénases ortho
9.6 - Déshalogénation aérobie avec ouverture du cycle
9.7 - Les cyclo-isomérases
9.8 - Hydrolases et réductases des voies ortho
9.9 - Déshalogénation aérobie après ouverture du cycle
Conclusion
CHAPITRE 10 - OUVERTURE EXTRADIO - VOIE DU GENTISATE
10.1- Rupture extradiol du cycle aromatique
10.2 - Le plasmide TOL
10.3 - Naphtalène et salicylate
10.4 - Les polycycliques
10.5 - Biphényle et PCB
10.6 - Dioxygénases de l'ouverture extradiol
10.7 - Aromatiques azotés
10.8 - Dioxines !
10.9 - Voie du gentisate
Conclusion
CHAPITRE 11 - LES AROMATIQUES À L'ABRI DE L'OXYGÈNE
11.1- Attaque anaérobie par les dénitrifiants
11.2 - Benzène - toluène - éthylbenzène - crésol
11.3 - La voie du benzylsuccinate
11.4 - La déshydroxylation du cycle aromatique
11.5 - Les voies anaérobies du benzoyl-coenzyme A
11.6 - Déshalogénations aérobies utilisant le coenzyme A
Conclusion
CHAPITRE 12 - ALIPHATIQUES ET ORGANOHALOGÉNÉS
12.1 - Les tristes marées noires
12.2 - Bactéries et levures sur aliphatiques
12.3 - L'intervention des bactéries
12.4 - Alicycliques et terpènes
12.5 - Le cytochrome P450 du camphre
12.6 - Dégradation anaérobie des aliphatiques
12.7 - Décontamination de solvants chlorés
12.8 - La déshalogénation et ses divers modes
12.9 - Déshalogénation hydrolytique des haloalcanes
12.10 - Le cas des 2-haloacides
Conclusion
CHAPITRE 13 - HERBICIDES - PESTICIDES - RÉCALCITRANTS
13.1 - Quelques aspects généraux
13.2 - Dégradation d'un herbicide
13.3 - Des herbicides chlorés
13.4 - Les acides phosphoniques - le Roundup
13.5 - Organophosphates - parathion et autres
13.6 - Organochlorés - Lindane et DDT
13.7 - Le pentachlorophénol
13.8 - Carbamates et pyréthroïdes
13.9 - Herbicides du groupe des triazines
13.10 - Anilides et analogues
13.11 - Sulfates - Sulfonates
13.12 - Les peroxydases, une arme absolue ?
Conclusion
CHAPITRE 14 - LA CIRCULATION DES MÉTAUX
14.1 - Gérer le taux de métal
14.2 - Le fer - un métal essentiel
14.3 - Quelques métaux indispensables
14.4 - Métaux et pollution
14.5 - Le pompage du cadmium et du zinc
14.6 - Le contrôle du plomb
14.7- La résistance au cuivre
14.8 -Transport par potentiel membranaire
14.9 - Mercure et mercuriels
14.10 - Résistances à l'arsenic et à l'antimoine
Conclusion