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Affectant les plus grands pays producteurs de la courgette, le WMV (Watermelon mosaic virus) est le plus important virus au niveau économique. Difficilement évité par contrôle chimique ou autres types d’intervention dans le champ, la manière plus effective d’éviter les dégâts causé par ce virus est d’utiliser des variétés résistantes. Afin de répondre à cette exigence du marché, les projets potyvirus chez HM CLAUSE cherchent obtenir plus de connaissance sur ce caractère et au même temps obtenir des marqueurs associés pour les utiliser en suite dans les projets de sélections.
Dans le cadre d’un projet de la résistance au WMV, ce stage de fin d’études avait comme objectif phénotyper plus de 190 familles provenant de 4 populations différentes issues des croisements entre parents résista[...]

Affectant les plus grands pays producteurs de la courgette, le WMV (Watermelon mosaic virus) est le plus important virus au niveau économique. Difficilement évité par contrôle chimique ou autres types d’intervention dans le champ, la manière plus effective d’éviter les dégâts causé par ce virus est d’utiliser des variétés résistantes. Afin de répondre à cette exigence du marché, les projets potyvirus chez HM CLAUSE cherchent obtenir plus de connaissance sur ce caractère et au même temps obtenir des marqueurs associés pour les utiliser en suite dans les projets de sélections.
Dans le cadre d’un projet de la résistance au WMV, ce stage de fin d’études avait comme objectif phénotyper plus de 190 familles provenant de 4 populations différentes issues des croisements entre parents résistants et sensibles. Avec les données de phénotypage générées dans cette étude, il est attendu identifier des QTL impliquées dans la résistance au WMV et aussi les possibles marqueurs liés à ces QTL, afin de les utiliser en routine dans la sélection variétale.
La mission de ce stage englobait toute la partie de mise en place de l’essai, organisation des différentes étapes, définition d’un protocole de phénotypage et l’évaluation des symptômes.
Deux répétitions de 1404 plantes ont été menées permettant de phénotyper 196 familles divisées en 4 populations provenant de deux pools de résistance différentes. En considérants les deux répétitions, un total de 11 774 fruits et 5 175 feuilles ont été récoltées et évalués par rapport leurs symptômes. Les données obtenues ont été ajustées selon le positionnement des plantes dans la parcelle afin d’avoir des données plus fiables pour les analyses. Les familles ont été distribuées selon leurs niveaux de résistance pour sélectionner celles plus résistantes et les plus sensibles afin de les comparées au niveau de génotype. Aussi une analyse de corrélation entre la résistance sur feuille et sur fruits a été faite qui a donné des indices qu’il existe des QTL indépendants pour ces caractères. Grâce à ces résultats, les analyses de QTL seront faites séparément pour les données feuilles et fruits. L’ensemble de données générées dans ce stage permettra de trouver les différents QTL impliqués dans ce caractère et aussi de trouver des marqueurs liés à ces QTL pour les utiliser en sélection dans un futur proche.

Affecting the most relevant countries for summer squash productions, the WMV (Watermelon mosaic virus) is the most important virus considering the economic impacts. Hard to avoid the contamination by chemical control (against the vector) or other field intervention, the most efficient way to avoid the damages caused by this virus is to use resistant varieties. To answer this market exigence, the HM.CLAUSE’s potyvirus projects try to learn more about this trait of resistance and at the same time discover associated markers to use them in future breeding programs.
In the WMV resistance project, this internship has the objective of phenotyping more than 190 families from 4 different populations created crossing resistant and susceptible parents. With all the phenotyping data generated in this internship, it will be possible to identify the QTL involved in the WMV resistance and also the linked markers to this trait, so the squash team could use this markers in routine.
The mission of this internship englobe all the preparation of the trial, the organization of the different steps of the experiment, the phenotyping protocol and the symptoms evaluations (phenotyping).
Two repetitions of 1404 plants were exploited allowing to phenotype 196 families from 4 populations from 2 resistances pools. Considering the two repetitions a total of 11.774 fruits and 5.175 leaves were collected and evaluated by their symptoms. The data collected was adjusted considering the plants position in the field to have more reliable results. The families were distributed according to their resistance levels to select those more resistant and more susceptible. These families will be compared considering the genotype. Also in this project, an analysis correlating the fruits and leaves resistance was made giving the indice that it exists different QTL for leaves and fruits resistance. Considering these results, the QTL analysis is going to be made separately for the leaves and fruits. With all the data generated in this internship, the HM.CLAUSE will be able to discover the QTL linked with the WMV resistance and the markers linked to this trait to be used in the breeding program in the future.