Titre : | Contribution à l'étude du gène de métallothionéine chez l'arbre tropical fixateur d'azote Casuarina glauca. | Type de document : | texte imprimé | Auteurs : | Hélène Hampartzoumian ; Nicole Vartanian, Responsable de stage | Editeur : | Paris : Ecole Nationale des Ponts et Chaussées (ENPC) | Année de publication : | 1996 | Autre Editeur : | ENGREF | Importance : | 57 p., biblio, annexes | Note générale : | DEA Sciences et techniques de l'environnement | Langues : | Français (fre) | Catégories : | Thésaurus Agrovoc Forêt tropicale ; Génétique ; Clone Autres descripteurs CASUARINA GLAUCA
| Résumé : | Casuarina glauca est un arbre tropical fixateur d'azote vivant en symbiose avec l'actinomycète du sol Frankia. L'établissement de la symbiose est le résultat de l'expression spécifique de certains gènes du micro-organisme et de la plante hôte qui aboutit à la formation d'un nouvel organe : le nodule. Dans le cadre de l'étude des gènes de C.glauca impliqués dans la symbiose, une banque d'ACNc, issus d'ARN messagers de nodule, a été construite au laboratoire BSFT. Le clone d'ADNc MT1-gTRI correspond à un gène de métallothionéine végétale. L'hybridation de l'ADN génomique de C. glauca, digéré par l'enzyme BamHI, avec la sonde MT1-CgTRI, indique un signal positif de taille 6 kb, suggérant que le gène de métallothionéine correspondant à l'ADNc MT1-CgTRI, est localisé sur ce fragment. Le but de mon stage était de participer à la caractérisation du gène de la métallothionéine de C.glauca. Dans ce contexte, j'ai construit une banque génomique afin de cloner le
fragment d'ADN de taille 6 kb dans le phage Emb13. Le clone MT1-CgTRI a été utilisé comme sonde moléculaire pour identifier les séquences homologues du fragment inséré dans le phage. La PCR réalisée sur l'ADN génomique de C.glauca utilisant des amorces choisies dans les régions 5' et 3' de la séquence d'ADNc MT1-CgTRI, a permis d'amplifier un fragment d'ADN d'environ 580 pb. L'amplifiat obtenu à partir du clone d'ADNc en utilisant les mêmes amorces étant d'environ 360 pb, ce résultat suggère la présence d'un ou de plusieurs introns dans le gène de métallothionéine de C.glauca. Au cours de l'analyse de la banque génomique, des fragments d'ADN de taille voisine de 580 pb ont été amplifiés par PCR. Ce résultat suggère la présence d'un clone phagique ayant incorporé le gène de métallothionéine. Cependant, en poursuivant l'analyse de chacun des clones phagiques en les transférant sur membrane et en les hybridant avec la sonde réalisée à partir de l'ADNc de
métallothionéine, aucun gène de MT n'a pu être détecté. L'hypothèse selon laquelle l'amplification obtenue par PR résulterait d'une contamination de notre échantillon par de l'ADN génomique, n'est dans ce cas pas à exclure. | Type de document : | Mémoire | Permalien de la notice : | https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=109605 |
Contribution à l'étude du gène de métallothionéine chez l'arbre tropical fixateur d'azote Casuarina glauca. [texte imprimé] / Hélène Hampartzoumian ; Nicole Vartanian, Responsable de stage . - Paris (FR) : Ecole Nationale des Ponts et Chaussées (ENPC) : [S.l.] : ENGREF, 1996 . - 57 p., biblio, annexes. DEA Sciences et techniques de l'environnement Langues : Français ( fre) Catégories : | Thésaurus Agrovoc Forêt tropicale ; Génétique ; Clone Autres descripteurs CASUARINA GLAUCA
| Résumé : | Casuarina glauca est un arbre tropical fixateur d'azote vivant en symbiose avec l'actinomycète du sol Frankia. L'établissement de la symbiose est le résultat de l'expression spécifique de certains gènes du micro-organisme et de la plante hôte qui aboutit à la formation d'un nouvel organe : le nodule. Dans le cadre de l'étude des gènes de C.glauca impliqués dans la symbiose, une banque d'ACNc, issus d'ARN messagers de nodule, a été construite au laboratoire BSFT. Le clone d'ADNc MT1-gTRI correspond à un gène de métallothionéine végétale. L'hybridation de l'ADN génomique de C. glauca, digéré par l'enzyme BamHI, avec la sonde MT1-CgTRI, indique un signal positif de taille 6 kb, suggérant que le gène de métallothionéine correspondant à l'ADNc MT1-CgTRI, est localisé sur ce fragment. Le but de mon stage était de participer à la caractérisation du gène de la métallothionéine de C.glauca. Dans ce contexte, j'ai construit une banque génomique afin de cloner le
fragment d'ADN de taille 6 kb dans le phage Emb13. Le clone MT1-CgTRI a été utilisé comme sonde moléculaire pour identifier les séquences homologues du fragment inséré dans le phage. La PCR réalisée sur l'ADN génomique de C.glauca utilisant des amorces choisies dans les régions 5' et 3' de la séquence d'ADNc MT1-CgTRI, a permis d'amplifier un fragment d'ADN d'environ 580 pb. L'amplifiat obtenu à partir du clone d'ADNc en utilisant les mêmes amorces étant d'environ 360 pb, ce résultat suggère la présence d'un ou de plusieurs introns dans le gène de métallothionéine de C.glauca. Au cours de l'analyse de la banque génomique, des fragments d'ADN de taille voisine de 580 pb ont été amplifiés par PCR. Ce résultat suggère la présence d'un clone phagique ayant incorporé le gène de métallothionéine. Cependant, en poursuivant l'analyse de chacun des clones phagiques en les transférant sur membrane et en les hybridant avec la sonde réalisée à partir de l'ADNc de
métallothionéine, aucun gène de MT n'a pu être détecté. L'hypothèse selon laquelle l'amplification obtenue par PR résulterait d'une contamination de notre échantillon par de l'ADN génomique, n'est dans ce cas pas à exclure. | Type de document : | Mémoire | Permalien de la notice : | https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=109605 |
|