Characterisation of genetic diversity in potential biomass willows (Salix spp.) by RAPD and AFLP anlyses / J.H.A. Barker (1999)

Public ISBD Titre : Characterisation of genetic diversity in potential biomass willows (Salix spp.) by RAPD and AFLP anlyses Type de document : texte imprimé Auteurs : J.H.A. Barker, Auteur ; Matthes M., Auteur ; G.M. Arnold, Auteur ; K.J. Edwards, Auteur ; A. Karp, Auteur Année de publication : 1999 Importance : pp.173-183 Présentation : ill., tabl., réf. Note générale : Extrait de Genome - Vol.42 - n°2 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; RAPD ; Biomasse ; Salix Résumé : Le genre Salix (saule) comprend plusieurs espèces qui montrent un grand potentiel comme source de biomasse dans des plantations à rotation courte (SRC; «short rotation coppice»). Les efforts visant à améliorer les saules à biomasse sont présentement limités par le peu d'information disponible sur la diversité génétique ainsi que les relations parmi et entre les espèces, entre les clones et entre les hybrides disponibles. Les hybridations surviennent régulièrement en nature et la parenté de nombreux clones est incertaine. Des marqueurs moléculaires ont été employés afin de déterminer la diversité génétique chez un ensemble de saules de référence qui sont maintenus au U.K. National Collection de même que chez 16 clones élites en cours d'évaluation en champs à plusieurs sites en Europe. Les deux systèmes de marqueurs, RAPD et AFLP, étaient aussi informatifs l'un que l'autre lors de l'étude des relations entre les clones faisant partie de l'ensemble de référence. Aucune différence n'a été observée lorsque des coefficients de similarité alternatifs ont été comparés ou lorsque l'analyse a été restreinte aux bandes polymorphes. Les données obtenues étaient en bon accord avec ce qui est connu de l'origine des différents clones et ont permis de repérer un cas de clones dupliqués. Les AFLP ont révélé davantage de diversité génétique et ont permis de distinguer des clones plus apparentés. Une différence au niveau des relations révélées a été observée avec une combinaison d'amorces AFLP. Les marqueurs RAPD étaient plus problématiques, à la fois en termes de reproductibilité et de lecture.Mots clés : Salix, saule, diversité, AFLP, RAPD, biomasse. Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=150061 Characterisation of genetic diversity in potential biomass willows (Salix spp.) by RAPD and AFLP anlyses [texte imprimé] / J.H.A. Barker, Auteur ; Matthes M., Auteur ; G.M. Arnold, Auteur ; K.J. Edwards, Auteur ; A. Karp, Auteur . - 1999 . - pp.173-183 : ill., tabl., réf. Extrait de Genome - Vol.42 - n°2 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; RAPD ; Biomasse ; Salix Résumé : Le genre Salix (saule) comprend plusieurs espèces qui montrent un grand potentiel comme source de biomasse dans des plantations à rotation courte (SRC; «short rotation coppice»). Les efforts visant à améliorer les saules à biomasse sont présentement limités par le peu d'information disponible sur la diversité génétique ainsi que les relations parmi et entre les espèces, entre les clones et entre les hybrides disponibles. Les hybridations surviennent régulièrement en nature et la parenté de nombreux clones est incertaine. Des marqueurs moléculaires ont été employés afin de déterminer la diversité génétique chez un ensemble de saules de référence qui sont maintenus au U.K. National Collection de même que chez 16 clones élites en cours d'évaluation en champs à plusieurs sites en Europe. Les deux systèmes de marqueurs, RAPD et AFLP, étaient aussi informatifs l'un que l'autre lors de l'étude des relations entre les clones faisant partie de l'ensemble de référence. Aucune différence n'a été observée lorsque des coefficients de similarité alternatifs ont été comparés ou lorsque l'analyse a été restreinte aux bandes polymorphes. Les données obtenues étaient en bon accord avec ce qui est connu de l'origine des différents clones et ont permis de repérer un cas de clones dupliqués. Les AFLP ont révélé davantage de diversité génétique et ont permis de distinguer des clones plus apparentés. Une différence au niveau des relations révélées a été observée avec une combinaison d'amorces AFLP. Les marqueurs RAPD étaient plus problématiques, à la fois en termes de reproductibilité et de lecture.Mots clés : Salix, saule, diversité, AFLP, RAPD, biomasse. Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=150061

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Comparison of genetic diversity estimates within and among populations of maritime pine using chloroplast simple-sequence repeat and amplified fragment length polymorphism data / M.M Ribeiro (2002)

Public ISBD Titre : Comparison of genetic diversity estimates within and among populations of maritime pine using chloroplast simple-sequence repeat and amplified fragment length polymorphism data Type de document : texte imprimé Auteurs : M.M Ribeiro, Auteur ; S. Mariette, Auteur ; G.G. Vendramin, Auteur ; A.E Szmidt, Auteur ; C. Plomion, Auteur ; A. Kremer, Auteur Editeur : Blackwell Science Ltd Année de publication : 2002 Importance : p.869-877 Présentation : graph., tabl., ref. Note générale : Extrait de Molecular Ecology, n°11 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; Pinus pinaster Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=158577 Comparison of genetic diversity estimates within and among populations of maritime pine using chloroplast simple-sequence repeat and amplified fragment length polymorphism data [texte imprimé] / M.M Ribeiro, Auteur ; S. Mariette, Auteur ; G.G. Vendramin, Auteur ; A.E Szmidt, Auteur ; C. Plomion, Auteur ; A. Kremer, Auteur . - GB : Blackwell Science Ltd, 2002 . - p.869-877 : graph., tabl., ref. Extrait de Molecular Ecology, n°11 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; Pinus pinaster Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=158577

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Comparison of PCR-based molecular marker analyses of musa breeding populations / J. H. Crouch (1999)

Public ISBD Titre : Comparison of PCR-based molecular marker analyses of musa breeding populations Type de document : texte imprimé Auteurs : J. H. Crouch, Auteur ; H. K. Crouch, Auteur ; H. Constandt, Auteur ; Avan Gysel, Auteur ; P. Breyne, Auteur ; Mvan Montague, Auteur ; R.L. Jarret, Auteur ; R. Ortiz, Auteur Année de publication : 1999 Importance : pp. 233-244 Présentation : tabl., réf. Note générale : Extrait de Molecular Breeding - Vol.5 - n°3 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc RAPD ; Amélioration des plantes ; AFLP ; Musa ; Plantation ; Marqueur génétique ; PCR Résumé : Progress in the breeding of plantain and banana has been restricted by the complex genetic structure and behaviour of cultivated polyploid Musa. Genetic improvement has been hindered due to the large amount of space required for growth and maintenance of plant populations, in addition to the long growth cycle and the low levels of fertility and seed viability characteristic of cultivated genotypes. Molecular marker assisted breeding has the potential to dramatically enhance the pace and efficiency of genetic improvement in Musa. This study was conducted to compare different PCR-based marker systems (RAPD, VNTR and AFLP) for the analysis of breeding populations generated from two diverse Musa breeding schemes. All three assays detected a high level of polymorphism between parental genotypes and within progeny populations. As expected, AFLP assays had by far the highest multiplex ratio while VNTR analysis detected the highest levels of polymorphism. AFLP analysis of a full-sib tetraploid hybrid population confirmed previous reports based on VNTR analysis, of a high frequency of recombination during 2n (3x) gamete formation by a triploid plantain landrace. In addition, both VNTR and RAPD analyses of a full-sib triploid hybrid population suggested a high frequency of homoeologous recombination during n (2x) gamete formation by tetraploid hybrids. In general, there was a poor correlation between estimates of genetic similarity based on different types of marker. The implications of these findings for the molecular breeding of Musa crops are discussed. Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=150062 Comparison of PCR-based molecular marker analyses of musa breeding populations [texte imprimé] / J. H. Crouch, Auteur ; H. K. Crouch, Auteur ; H. Constandt, Auteur ; Avan Gysel, Auteur ; P. Breyne, Auteur ; Mvan Montague, Auteur ; R.L. Jarret, Auteur ; R. Ortiz, Auteur . - 1999 . - pp. 233-244 : tabl., réf. Extrait de Molecular Breeding - Vol.5 - n°3 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc RAPD ; Amélioration des plantes ; AFLP ; Musa ; Plantation ; Marqueur génétique ; PCR Résumé : Progress in the breeding of plantain and banana has been restricted by the complex genetic structure and behaviour of cultivated polyploid Musa. Genetic improvement has been hindered due to the large amount of space required for growth and maintenance of plant populations, in addition to the long growth cycle and the low levels of fertility and seed viability characteristic of cultivated genotypes. Molecular marker assisted breeding has the potential to dramatically enhance the pace and efficiency of genetic improvement in Musa. This study was conducted to compare different PCR-based marker systems (RAPD, VNTR and AFLP) for the analysis of breeding populations generated from two diverse Musa breeding schemes. All three assays detected a high level of polymorphism between parental genotypes and within progeny populations. As expected, AFLP assays had by far the highest multiplex ratio while VNTR analysis detected the highest levels of polymorphism. AFLP analysis of a full-sib tetraploid hybrid population confirmed previous reports based on VNTR analysis, of a high frequency of recombination during 2n (3x) gamete formation by a triploid plantain landrace. In addition, both VNTR and RAPD analyses of a full-sib triploid hybrid population suggested a high frequency of homoeologous recombination during n (2x) gamete formation by tetraploid hybrids. In general, there was a poor correlation between estimates of genetic similarity based on different types of marker. The implications of these findings for the molecular breeding of Musa crops are discussed. Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=150062

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Crop Science, Vol 39. Amplified fragment polymorphism analys of tef (eragrostis tef (zucc.) trotter) / Guihua Bai (1999)

Public ISBD Titre de série : Crop Science, Vol 39 Titre : Amplified fragment polymorphism analys of tef (eragrostis tef (zucc.) trotter) Type de document : texte imprimé Auteurs : Guihua Bai, Auteur ; Mulu Ayele, Auteur ; H. Tefera, Auteur ; Henry T. Nguyen, Auteur Année de publication : 1999 Importance : pp. 819-824 Présentation : ill., tabl., réf. Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; PCR ; RAPD ; RFLP ; Éthiopie ; Eragrostis ; Polymorphisme Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=150065 Crop Science, Vol 39. Amplified fragment polymorphism analys of tef (eragrostis tef (zucc.) trotter) [texte imprimé] / Guihua Bai, Auteur ; Mulu Ayele, Auteur ; H. Tefera, Auteur ; Henry T. Nguyen, Auteur . - 1999 . - pp. 819-824 : ill., tabl., réf. Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; PCR ; RAPD ; RFLP ; Éthiopie ; Eragrostis ; Polymorphisme Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=150065

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Genetic diversity within and among populations: comparison between AFLP and microsatellite markers / Stéphanie Mariette (2001)

Public ISBD Titre : Genetic diversity within and among populations: comparison between AFLP and microsatellite markers Type de document : texte imprimé Auteurs : Stéphanie Mariette, Auteur ; David Chagné, Auteur ; Celine Lézier, Auteur ; Patrick Pastuszka, Auteur ; Annie Raffin, Auteur ; Christophe Plomion, Auteur ; Antoine Kremer, Auteur Année de publication : 2001 Importance : p.469-479 Présentation : graph., tabl., ref. Note générale : Extrait de Heredity, n°88 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; Pinus pinaster Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=158568 Genetic diversity within and among populations: comparison between AFLP and microsatellite markers [texte imprimé] / Stéphanie Mariette, Auteur ; David Chagné, Auteur ; Celine Lézier, Auteur ; Patrick Pastuszka, Auteur ; Annie Raffin, Auteur ; Christophe Plomion, Auteur ; Antoine Kremer, Auteur . - 2001 . - p.469-479 : graph., tabl., ref. Extrait de Heredity, n°88 Langues : Anglais (eng) Catégories : Thésaurus Agrovoc AFLP ; Pinus pinaster Type de document : Tiré à part Permalien de la notice : https://infodoc.agroparistech.fr/index.php?lvl=notice_display&id=158568

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Kourou	Archives	AgroParisTech-Kourou	UMR.2295	Papier Périodique	5472	Empruntable

Patterns of genetic diversity and biogeographical history of the tropical wetland tree, Pterocarpus officinalis (Jacq.), in the Caribbean basin / E Rivera-Ocasio (2002)

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TAG Theoretical and Applied Genetics, Vol 99 - n°1-2. Assessment of genetic diversity in azadirachta indica using AFLP markers / A. Singh (1999)

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